看清细胞的“前世有缘”
日期:2023年05月10日 来源:历史人物
活细胞会高通量记录细胞会的叠加示意图。
深圳晚报通讯员 袁斯茹
细胞会同台的“恐怖片”,你会来看吗?8月17日,吉林大学深圳先进设备关键技术研究院合成病理学研究所研究员陈万泽以共同第一作者身为,在国际上顶级期刊《自然》(Nature)上刊出成章,详述了团队在国际上首创的活细胞会核糖体四组高通量关键技术(Live-seq)。
近日,该关键技术可以在细胞会始终保持存活的完全下,看清它的“前世有缘”。
监视细胞会高效率叠加
要明白细胞会的过去、现在和未来,只能知道它们在并不相同等待时间里基因序列表示的叠加。
当前,单细胞会核糖体四组高通量关键技术是明白细胞会完全的重要行为,就像看一张“全高清拍下”,通过单细胞会高通量能够看清细胞会当下基因序列的表示完全。但是细胞会完全的叠加其实更像“恐怖片”,而“拍下”无论如何无法认出它的过去和未来。
“利用单细胞会核糖体四组高通量关键技术的前提,是只能将细胞会裂解,分离出来其中的RNA来探测每个基因序列表示量的高者,但这样就不能能避免地‘处死’死了细胞会。”陈万泽说道。
通过近七年的努力,陈万泽与合作者联合开发了活细胞会核糖体四组高通量关键技术Live-seq,其核心是通过对活细胞会中的其余部分细胞会质同步进行微创分离出来,并对极其微量的细胞会质RNA同步进行缩减到,实现在同步进行单细胞会核糖体四组高通量后,依旧始终保持细胞会的存活和功能,从而可以监视细胞会的高效率叠加。
学术论文通讯作者、巴塞尔法国巴黎联邦康奈尔大学讲师Bart Deplancke表示,该关键技术兼具全基因序列表示分辨率和高效率验证意志力,是目前对单细胞会核糖体四组直接高效率校准、偶联细胞会现有完全和其紧接著基因型的唯一解决办法。
“捞”出细胞会中的RNA
如何在不处死死细胞会的前提下,认出细胞会的高效率叠加?
“我们首先忘了的是外泌体,它是细胞会向外面吐出来的小泡,里面有酶、RNA等微粒。如果我们把单个细胞会的外泌体都收集起来,再对其中的RNA同步进行校准,无论如何就可以在一定程度上反映细胞会完全而又不处死死细胞会。”陈万泽说道。
随后,陈万泽尝试利用在生命科学课题商业性的执行机构电子显微镜,这种设备上有一个很尖的硅探头,多用来探测微粒表面性质。
“这种探头很细,对细胞会的损伤很小,就像‘鱼骨’一样,改建工程后可以把细胞会中的RNA‘捞’出来,又能保证细胞会其后存活。我们改建工程了数十个探头后,结果只在两个细胞会上成功‘捞’到了基因序列。”陈万泽回忆道。当时购买一个执行机构电子显微镜探头只能800美元,研究成本很低,成功率太低,让这项研究其后陷于阻碍。
巴塞尔法国巴黎联邦康奈尔大学学科专业交叉意念浓厚,在一次偶然的学术研究中,陈万泽与讲师明白到,巴塞尔日内瓦联邦康奈尔大学的Julia Vorholt检验室联合开发了一种特殊的执行机构电子显微镜,能够吸出一其余部分的细胞会质。
一番交流后,两个课题四组四人,告一段落了联合攻关。联合团队对一系列的检验过程同步进行了优化,以保证检验结果的可靠性。
近日,利用这种方式,细胞会存活率能达到85%~89%之间。
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